Usa-Places.com ha enumerado aproximadamente 28 iglesias en San Juan Capistrano. Algunos de los iglesiasmejor calificados en San Juan Capistrano son- Capilla Calvario San Juan Capistrano, Iglesia Saddleback Rancho Capistrano, Iglesia de los marineros del sur del condado, Iglesia de Mountain View, Ministerio Bíblico Berea, Iglesia de celebración, Iglesia Bíblica Revolucionar, la iglesia de San Juan Capistrano, Misión Cristiana Fuente de Vida & Iglesia del rancho.